Keitaro Urashima a 19 ans, il vient d'échouer pour la seconde fois à l'examen d'entrée de la prestigieuse Tôdai, l'Université de Tokyo (Tokyo Daigaku).
Quinze ans auparavant, lui et une mystérieuse petite fille dont il a oublié le nom s'étaient fait la promesse de se retrouver à Todai une fois grands afin d'être heureux pour la vie. Depuis, aucune fille n'a plus jamais accordé à Keitaro un seul regard. Désespéré, il place tous ses espoirs dans cette université afin de retrouver son amour d'enfance ou, tout au moins, jouir du prestige d'étudiant de Todai pour séduire les jeunes filles.
Lassés de ses échecs, ses parents le jettent dehors et il décide alors de venir s'installer dans l'auberge tenue par sa grand-mère, le ryôkan (hôtel) Hinata. Mais l'hôtel est devenue une pension pour jeunes filles. Prenant un bain pour se détendre du voyage, Keitarô se heurte aux pensionnaires qui le prennent pour un pervers. Très réticentes à l'installation d'un garçon, elles sont forcées de l'accepter lorsque sa grand-mère fait de lui le gérant de la pension. L'une des filles, Naru, qui souhaite également intégrer Tôdai, est étrangement émue par l'histoire de la promesse de Keitaro, et elle va alors tenter d'aider celui-ci à réussir ses examens.
Keitarô Urashima : le SFF (Sans Fac Fixe), héros redoublant, raté, et sans succès auprès des filles.
Naru Narusegawa : une fille de la pension qui veut également entrer à Tôdai, elle devient rapidement l'autre personnage principal et entretient une relation ambigüe avec Keitarô.
Mutsumi Otohime : une mystérieuse fille très fragile que Keitarô et Naru rencontrent au cours d'un voyage. Complètement déphasée du monde, elle veut malgré tout entrer à Tôdai.
Shinobu Maehara : la cadette de la pension. Elle tombe rapidement amoureuse de Keitarô mais sa forte timidité l'empêche de le lui avouer.
Motoko Aoyama : une kendoka assez garçon manqué dans son caractère, et colérique, qui considère Keitarô comme un intrus dans la pension.
Kaora Sû : légèrement plus agée que Shinobu, c'est une jeune fille surexcitée et l'inventrice de nombreux appareils loufoques. Elle est étrangère, et raffole des bananes !
Mitsune "Kitsune" Konno : l'ainée des filles de la pension est aussi une grande consommatrice de saké et autres alcools, et ayant un tempérament pervers et obscène. Vénale mais sans volonté pour s'investir dans un vrai travail, elle tente plutôt sa chance dans le jeu, les courses hippiques notamment.
Haruka Urashima : la tante de Keitarô est aussi la gérante du café Hinata.
Kanako Urashima : la s½ur de Keitarô au tempérament très secret, elle est amoureuse de son frère et jalouse Naru qui retient toute son attention. Elle maîtrise aussi parfaitement l'art du déguisement et de l'imitation mais elle n'est pas la s½ur de sang de Keitaro...
Tama : une tortue de mer volante TRES étrange que Mutsumi a offert à Keitarô.